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小贴士:疫情-疫苗-病毒突变

6已有 1799 次阅读  2021-04-11 15:18
截止这个周末全球疫情通报如下:

I -世界疫情, 全球新冠总感染人数为135698888人。总死亡人数为2932956人。

1) 亚洲疫情:昨日,印度新增新冠患者69592人;日本新增3587人;印尼新增4723人;菲律宾新增12655人;孟加拉新增5343人。土耳其新增52676人。
2)欧洲疫情
俄罗斯昨日新增新冠患者8704人。德国新增 18693人。法国新增 43284人。英国新增2584人。意大利新增17551人。西班牙新增__人。
3)拉美疫情:
巴西昨日新增新冠患者69592人;哥伦比亚新增14509人。阿根廷新增19419人。智利新增8101人。墨西哥新增6356人。
4)非洲疫情:
南非昨日新增新冠患者1285人。埃塞俄比亚新增1739人。摩洛哥新增740人。

II.美国疫情
昨日美国新增新冠患者65132人。总确诊人数为31567756人。新增死亡人数635人。总死亡 569569人。死亡率1.8%。总康复人数为10534374人。

至今全美已接种疫苗的人数为:183,467,709, (美国有331M人口,183/331~=55%, 美国有过一半的人至少接种一针疫苗)
至今康州已接种疫苗人数为:2391842 (out of 3.5M, 65%, 其他新英格兰地区j接种比例与康州类似); 纽约州已接种疫苗人数为:11811282;新泽西州已接种疫苗人数为:5495689人,马萨诸塞州已接种疫苗人数为:4461283;马里兰州已接种疫苗人数为:3513930

目前covid-19 产生了3种新型突变体。主要集中在病毒表面spike 蛋白上。我们目前使用的 mRNA 疫苗是用全长序列生产的。在研发阶段生物制药公司曾经试图使用较短的 trimmed mRNA 片段生产疫苗,但未获成功。尽管是使用病毒的全长RNA序列,科学家依然认为大概率是病毒的乳突(spike)蛋白部分是最具备免疫源性的。选择免疫原性片段是疫苗产生效果的关键环节。请看 covid-19 病毒侵染肺细胞的机制。

covid-19 的可能侵染机制。病毒的表面蛋白之一乳突蛋白和人类细胞的两个蛋白受体TMPRSS2和ACE2识别和结合,导致病毒附在细胞表面,而后病毒粒子融合到细胞表面,释放病毒RNA。病毒RNA在细胞内绑架细胞自身的合成机制,滚筒式、往复式复制病毒核酸, 再包装成新的病毒粒子。感染邻近细胞,最后破坏肺细胞导致肺炎。 

科学家把covid-19的乳突蛋白区分出不同的亚基。今年最早发现的的英国突变和南非突变主要是集中在S1亚基上( tuiquoise颜色),这两个突变体有很多相同的突变位点(如N501Y, 表示第501位置的氨基酸由N突变成Y,del144,第144号氨基酸删除缺失, 等等)。目前美国应用的疫苗尚对这两个突变株还有足够的保护作用。

最新发现的巴西突变,与英国和南非突变株相比,共同点很少。科学家担心的是在蛋白的羟基端(左手起点端,图中的cyan 颜色区, L18F, T20N,P26S, 就是第18, 20, 26 号氨基酸同时发生了突变!)产生了全新的突变,这个蘑菇头位置的几个氨基酸可能是识别病毒和病毒侵染的关键基团。因此,巴西的突变有可能绕过现有的疫苗和前期痊愈的病人体内产生的抗体。

在流行病学上,有一个理论模型是: 保护效率低的措施,比如疫苗和抗生素,更容易诱导病菌产生突变。

这个很容易理解。如果疫苗和抗生素100%高效,那就是直接把病毒灭门了。没有给它突变产生的机会。而低水平大规模的应用保护效率低的措施,在某些条件下,可能成为一个公共卫生的负面因素。就covid-19 疫苗而言,去年俄罗斯是第一个推出并使用俄版的疫苗的。当时就有美国cdc专家和疫苗专业人士表示过这个担忧。怕疫苗效率不高+应用不当会导致病毒出现新的变种,从而使其他机构在研的疫苗也一同失效胎死腹中。

所以前文说的中疾控主任高福披露2家中国公司生产的疫苗效率虽然不够高,但在全球推广却是最快。是否会产生巨大的诱发突变效应还有待专业人士拍砖。好像巴西就是参与中国灭活疫苗的一个三期试验的地方,记得之前还有什么信披及时不及时的新闻来着。

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